Cilj igre Minecraft je pobijediti Ender Dragona te skupiti sve “Napretke” kao što su “Dobivanje nadogradnje”. Igrač u svakom trenutku može igrati u prvom ili trećem licu. Da bi pokupio neku kocku, prvo ju treba uništiti. Ako se prilikom uništavanja rabio ispravan alat, igrač može pokupiti kocku, inače kocka nestaje. Neki se predmeti mogu beskonačno proizvoditi, npr. kamen dodirom tekuće vode i lave, pšenica, drvo i sirova svinjetina. 3D Minecraft svijet sastoji se od niza poravnatih kocaka oblikovanih kao teren, npr. planine, doline, mora… Igrači uništavaju ove kocke i postavljaju ih drugdje stvarajući razne konstrukcije.
U Minecraftu postoje tri dimenzije: Overworld (Nadsvijet), Nether (Neter) i The End (Kraj). Nadsvijet je dimenzija u kojemu je igrač na početku kad stvori novi svijet.
U igri Minecraft fizički svijet nije sličan onoj na Zemlji, i kao neki posebni magični svijet koji ima svoja pravila tako da Minecraft okruženje ima nerealistična i nadnaravna pravila. Na primjer kocke mogu lebdjeti u zraku bez ikakve potpore, s izuzetkom pijeska, šljunka i još nekih. Voda i lava teku iz početne kocke koji se može ukloniti postavljanjem bilo koje kocke na njegovo mjesto.
Igra se sastoji od 4 načina igre te 4 težine igre.